Ma’had Aly menjadi salah satu alternatif pilihan umat Islam di Indonesia dalam mewujudkan ilmu agama Islam sebagai rahmat bagi seluruh alam. Semuanya dijadikan sebagai wahana pengembangan ilmu agama Islam. Di dalam Ma’had Aly diberikan materi kurikulum pendidikan yang tidak jauh berbeda dengan kurikulum pesantren (lebih mendalam) dengan mengakomodasi ilmu-ilmu modern yang sangat diperlukan mahasiswa.
Dengan demikian Ma’had Aly secara tidak langsung dapat dikatakan sebagai pesantren plus akademik sebagaimana perguruan tinggi lain di Indonesia. Artinya bahwa Ma’had Aly merupakan institusi yang mempunyai dua fungsi dasar yakni lembaga dakwah dan lembaga akademis. [Dr. Abdul Djalal, MA]